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検索結果

検索 (著者・登録者: ehrenberg & m)の結果89件中、1から50件目までを表示しています

EMDB-41617:
CryoEM structure of PI3Kalpha
手法: 単粒子 / : Valverde R, Shi H, Holliday M, Sun M

PDB-8tu6:
CryoEM structure of PI3Kalpha
手法: 単粒子 / : Valverde R, Shi H, Holliday M

EMDB-26705:
allo-tRNAUTu1 in the A, P, and E sites of the E. coli ribosome
手法: 単粒子 / : Zhang J, Krahn N, Prabhakar A, Vargas-Rodriguez O, Krupkin M, Fu Z, Acosta-Reyes FJ, Ge X, Choi J, Crnkovic A, Ehrenberg M, Viani Puglisi E, Soll D, Puglisi J

EMDB-26713:
allo-tRNAUTu1A in the A site of the E. coli ribosome
手法: 単粒子 / : Zhang J, Prabhakar A, Krahn N, Vargas-Rodriguez O, Krupkin M, Fu Z, Acosta-Reyes FJ, Ge X, Choi J, Crnkovic A, Ehrenberg M, Viani Puglisi E, Soll D, Puglisi J

EMDB-26714:
allo-tRNAUTu1A in the P site of the E. coli ribosome
手法: 単粒子 / : Zhang J, Prabhakar A, Krahn N, Vargas-Rodriguez O, Krupkin M, Fu Z, Acosta-Reyes FJ, Ge X, Choi J, Crnkovic A, Ehrenberg M, Viani Puglisi E, Soll D, Puglisi J

PDB-7ur5:
allo-tRNAUTu1 in the A, P, and E sites of the E. coli ribosome
手法: 単粒子 / : Zhang J, Krahn N, Prabhakar A, Vargas-Rodriguez O, Krupkin M, Fu Z, Acosta-Reyes FJ, Ge X, Choi J, Crnkovic A, Ehrenberg M, Viani Puglisi E, Soll D, Puglisi J

PDB-7uri:
allo-tRNAUTu1A in the A site of the E. coli ribosome
手法: 単粒子 / : Zhang J, Prabhakar A, Krahn N, Vargas-Rodriguez O, Krupkin M, Fu Z, Acosta-Reyes FJ, Ge X, Choi J, Crnkovic A, Ehrenberg M, Viani Puglisi E, Soll D, Puglisi J

PDB-7urm:
allo-tRNAUTu1A in the P site of the E. coli ribosome
手法: 単粒子 / : Zhang J, Prabhakar A, Krahn N, Vargas-Rodriguez O, Krupkin M, Fu Z, Acosta-Reyes FJ, Ge X, Choi J, Crnkovic A, Ehrenberg M, Viani Puglisi E, Soll D, Puglisi J

EMDB-20184:
RF1 accommodated 70S complex at 60 ms
手法: 単粒子 / : Fu Z, Indrisiunaite G, Kaledhonkar S, Shah B, Sun M, Chen B, Grassucci RA, Ehrenberg M, Frank J

EMDB-20187:
RF1 accommodated state bound Release complex 70S at long incubation time point
手法: 単粒子 / : Fu Z, Indrisiunaite G, Kaledhonkar S, Shah B, Sun M, Chen B, Grassucci RA, Ehrenberg M, Frank J

PDB-6osk:
RF1 accommodated 70S complex at 60 ms
手法: 単粒子 / : Fu Z, Indrisiunaite G, Kaledhonkar S, Shah B, Sun M, Chen B, Grassucci RA, Ehrenberg M, Frank J

PDB-6osq:
RF1 accommodated state bound Release complex 70S at long incubation time point
手法: 単粒子 / : Fu Z, Indrisiunaite G, Kaledhonkar S, Shah B, Sun M, Chen B, Grassucci RA, Ehrenberg M, Frank J

EMDB-20173:
Release complex 70S
手法: 単粒子 / : Fu Z

EMDB-20174:
RF1 pre-accommodated 70S complex at 24 ms
手法: 単粒子 / : Fu Z, Indrisiunaite G, Kaledhonkar S, Shah B, Sun M, Chen B, Grassucci RA, Ehrenberg M, Frank J

EMDB-20188:
RF2 pre-accommodated state bound Release complex 70S at 24ms
手法: 単粒子 / : Fu Z, Indrisiunaite G, Kaledhonkar S, Shah B, Sun M, Chen B, Grassucci RA, Ehrenberg M, Frank J

EMDB-20193:
RF2 accommodated state bound Release complex 70S at 24 ms
手法: 単粒子 / : Fu Z, Indrisiunaite G, Kaledhonkar S, Shah B, Sun M, Chen B, Grassucci RA, Ehrenberg M, Frank J

EMDB-20204:
RF2 accommodated state bound 70S complex at long incubation time
手法: 単粒子 / : Fu Z, Indrisiunaite G

PDB-6ore:
Release complex 70S
手法: 単粒子 / : Fu Z

PDB-6orl:
RF1 pre-accommodated 70S complex at 24 ms
手法: 単粒子 / : Fu Z, Indrisiunaite G, Kaledhonkar S, Shah B, Sun M, Chen B, Grassucci RA, Ehrenberg M, Frank J

PDB-6ost:
RF2 pre-accommodated state bound Release complex 70S at 24ms
手法: 単粒子 / : Fu Z, Indrisiunaite G, Kaledhonkar S, Shah B, Sun M, Chen B, Grassucci RA, Ehrenberg M, Frank J

PDB-6ot3:
RF2 accommodated state bound Release complex 70S at 24 ms
手法: 単粒子 / : Fu Z, Indrisiunaite G, Kaledhonkar S, Shah B, Sun M, Chen B, Grassucci RA, Ehrenberg M, Frank J

PDB-6ouo:
RF2 accommodated state bound 70S complex at long incubation time
手法: 単粒子 / : Fu Z, Indrisiunaite G, Kaledhonkar S, Shah B, Sun M, Chen B, Grassucci RA, Ehrenberg M, Frank J

EMDB-8826:
70S ribosome-EF-Tu H84A complex with GTP and near-cognate tRNA (Complex C2)
手法: 単粒子 / : Fislage M, Frank J

EMDB-8828:
70S ribosome-EF-Tu H84A complex with GTP and near-cognate tRNA (Complex C3)
手法: 単粒子 / : Fislage M, Frank J

EMDB-8829:
70S ribosome-EF-Tu H84A complex with GTP and near-cognate tRNA (Complex III)
手法: 単粒子 / : Fislage M, Frank J

PDB-5wf0:
70S ribosome-EF-Tu H84A complex with GTP and near-cognate tRNA (Complex C2)
手法: 単粒子 / : Fislage M, Frank J

PDB-5wfk:
70S ribosome-EF-Tu H84A complex with GTP and near-cognate tRNA (Complex C3)
手法: 単粒子 / : Fislage M, Frank J

PDB-5wfs:
70S ribosome-EF-Tu H84A complex with GTP and near-cognate tRNA (Complex C4)
手法: 単粒子 / : Fislage M, Frank J

EMDB-8813:
70S ribosome-EF-Tu H84A complex with GppNHp
手法: 単粒子 / : Fislage M, Brown Z

EMDB-8814:
70S ribosome-EF-Tu H84A complex with GppNHp
手法: 単粒子 / : Fislage M, Brown Z

EMDB-8815:
70S ribosome-EF-Tu H84A complex with GTP and cognate tRNA
手法: 単粒子 / : Fislage M, Frank J

PDB-5wdt:
70S ribosome-EF-Tu H84A complex with GppNHp
手法: 単粒子 / : Fislage M, Brown Z, Frank J

PDB-5we4:
70S ribosome-EF-Tu wt complex with GppNHp
手法: 単粒子 / : Fislage M, Brown Z, Frank J

PDB-5we6:
70S ribosome-EF-Tu H84A complex with GTP and cognate tRNA
手法: 単粒子 / : Fislage M, Frank J

EMDB-8411:
Time-resolved cryo electron microscopy map of the RRF-bound post-termination ribosome complex
手法: 単粒子 / : Fu Z, Kaledhonkar S, Borg A, Sun M, Chen B, Grassucci RA, Ehrenberg M, Frank J

EMDB-8412:
Time-resolved cryo electron microscopy map of the RRF-bound post-termination ribosome complex
手法: 単粒子 / : Fu Z, Kaledhonkar S, Borg A, Sun M, Chen B, Grassucci RA, Ehrenberg M, Frank J

EMDB-8413:
Time-resolved cryo electron microscopy map of the EF-G and RRF-bound post-termination ribosome complex
手法: 単粒子 / : Fu Z, Kaledhonkar S, Borg A, Sun M, Chen B, Grassucci RA, Ehrenberg M, Frank J

EMDB-8415:
Time-resolved cryo electron microscopy map of the EF-G and RRF-bound 50S subunit
手法: 単粒子 / : Fu Z, Kaledhonkar S, Borg A, Sun M, Chen B, Grassucci RA, Ehrenberg M, Frank J

EMDB-8416:
Time-resolved cryo electron microscopy map of the EF-G-, RRF-, and tRNA-bound 50S subunit
手法: 単粒子 / : Fu Z, Kaledhonkar S, Borg A, Sun M, Chen B, Grassucci RA, Ehrenberg M, Frank J

EMDB-8417:
Time-resolved cryo electron microscopy map of the tRNA-bound 30S subunit
手法: 単粒子 / : Fu Z, Kaledhonkar S, Borg A, Sun M, Chen B, Grassucci RA, Ehrenberg M, Frank J

EMDB-8418:
Time-resolved cryo electron microscopy map of the IF3-bound 30S subunit
手法: 単粒子 / : Fu Z, Kaledhonkar S, Borg A, Sun M, Chen B, Grassucci RA, Ehrenberg M, Frank J

PDB-4v69:
Ternary complex-bound E.coli 70S ribosome.
手法: 単粒子 / : Villa E, Sengupta J, Trabuco LG, LeBarron J, Baxter WT, Shaikh TR, Grassucci RA, Nissen P, Ehrenberg M, Schulten K, Frank J

EMDB-1564:
Recognition of Phe-tRNAPhe, Trp-tRNATrp and : a common molecular mechanism for aminoacyl-tRNA selection revealed by cryo-EM
手法: 単粒子 / : Li W, Agirrezabala X, Lei J, Bouakaz L, Brunelle JL, Ortiz-Meoz RF, Green R, Sanyal S, Ehrenberg M, Frank J

EMDB-1565:
Recognition of Phe-tRNAPhe, Trp-tRNATrp and : a common molecular mechanism for aminoacyl-tRNA selection revealed by cryo-EM
手法: 単粒子 / : Li W, Agirrezabala X, Lei J, Bouakaz L, Brunelle JL, Ortiz-Meoz RF, Green R, Sanyal S, Ehrenberg M, Frank J

EMDB-5036:
Aminoacyl-tRNA-EF-Tu-GDP-kir ternary complex-bound E. coli 70S ribosome
手法: 単粒子 / : Villa E, Sengupta J, Trabuco LG, LeBarron J, Baxter WT, Shaikh TR, Grassucci RA, Nissen P, Ehrenberg M, Schulten K, Frank J

PDB-3ep2:
Model of Phe-tRNA(Phe) in the ribosomal pre-accommodated state revealed by cryo-EM
手法: 単粒子 / : Frank J, Li W, Agirrezabala X

PDB-3eq3:
Model of tRNA(Trp)-EF-Tu in the ribosomal pre-accommodated state revealed by cryo-EM
手法: 単粒子 / : Frank J, Li W, Agirrezabala X

PDB-3eq4:
Model of tRNA(Leu)-EF-Tu in the ribosomal pre-accommodated state revealed by cryo-EM
手法: 単粒子 / : Frank J, Li W, Agirrezabala X

PDB-2rdo:
50S subunit with EF-G(GDPNP) and RRF bound
手法: 単粒子 / : Gao N, Zavialov AV, Ehrenberg M, Frank J

EMDB-1430:
Specific interaction between EF-G and RRF and its implication for GTP-dependent ribosome splitting into subunits.
手法: 単粒子 / : Gao N, Zavialov A, Ehrenberg M, Frank J

ページ:

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EMN検索について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

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EMN検索

3次元電子顕微鏡データ検索

豊富な検索条件と表示条件で、EMDBとPDBの電子顕微鏡エントリを検索できます。

関連情報:EMDB / PDB / EM Navigator / Q: EM Navigatorの情報源は？ / 万見検索 / 2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

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